La Baie d'Audierne est un site naturel majeur de Bretagne, sa notoriété est internationale.
L'intérêt de la baie d'Audierne réside autant dans la valeur intrinsèque des milieux que dans leurs nombres, leurs variations et leur juxtaposition, mais aussi dans sa situation de carrefour bioclimatique ou d'étape migratoire.

Soumis à une dynamique géomorphologique importante, le site est constitué d'un ensemble de lagunes et de bas marais. Les eaux y sont confinées par un ensemble de cordons de galets et de dunes mobiles ou embryonnaires. A l'abri de vastes roselières ou dans de vastes plaines dunaires thermophiles à hélichrysum, plus de 300 espèces d'oiseaux nichent ou trouvent une étape migratoire salutaire.

Si au nord de la baie d'Audierne, les grands ensembles marécageux sont dominants, la végétation des dunes fixées au sud est majeure. La bulbiculture - une activité économique dynamique ici - y trouve un terrain d'expansion favorable ; son corollaire est la pression qui en résulte sur les milieux naturels et la qualité des eaux notamment. Cela impose un regard protecteur sur ce site. Particulièrement vigilant, le Conservatoire a fait de ce site un des secteurs majeurs de ses interventions.